Redovi cianobakterij
Chroococcales
Za ta red so značilne majhne celice, ki so v premeru dolge nekaj mikrometrov. V celicah so vidne plinske vakuole. Celice so običajno organizirane v kolonijah, pri čemer lahko velike kolonije opazimo tudi s prostim očesom. Kolonije pogosto obdaja mukozni ovoj. Mlade kolonije so okrogle oblike, s časom pa lahko postajajo luknjičaste (perforirane) in nepravilnih oblik.
Oscillatoriales
Red vključuje filamentozne oz. nitaste cianobakterije, ki so znane po svojem nihajočem gibanju. Vrste so večinoma modro-zelene, rjavo-zelene ali škrlatne barve. Kolonije so sestavljene iz filamentov celic, ki se lahko razbijejo na krajše filamente. Ne tvorijo heterocist in akinet. Razpoke na filamentu se največkrat pojavijo takrat, kadar so znotraj filamenta prisotne mrtve celice. V celicah so pogosto vidne plinske vakuole.
Nostocales
Filamenti se pojavljajo bodisi posamezno ali v kolonijah, so goli ali obdani s sluznim ovojem. Oblike celic so navadno okrogle ali sodčkaste, le redko valjaste oblike. V vegetativnih celicah so lahko vidne plinske vakuole. Heterociste so navadno enake oblike kot vegetativne celice, včasih nekoliko večje in se običajno pojavljajo znotraj filamenta. Običajno so heterociste prisotne v vsakem trihomu. Akinete se razvijejo ob heterocistah in/ali v njihovi bližini, so večje od vegetativnih celic, valjaste in z zaobljenimi konci.